山西农业大学农业工程学院的办学历史较为悠久。其前身可追溯至 1931 年私立铭贤学堂开设的工科部。1932 年，工科机械系招收了学生，所开设的课程以农业机械专业方向为核心。1940 年成立的铭贤农工专科学校，设置了农学部和工学部。农学部设有农业工程等三科，工科部设有机械工程等三科。山西农学院于 1951 年成立，设立了农业机械化教研室。1960 年开办了农业机械化专业。山西农业大学于 1979 年成立，设置了农机系。1994 年，农机系更名为农业工程系。随着学科专业的建设与发展，2000 年山西农业大学整合农业工程系成立了工程技术学院。2009 年，工程技术学院更名为工学院。2020 年山西农业大学进行了合署改革，与山西省农业科学院合在一起。其中，工学院改名为农业工程学院。

学院经过几十年的学科专业建设与发展，构建了包含本科生教育以及硕博士研究生教育的多层次人才培养体系。学院具备农业工程一级学科博士学位授权点，还有农业工程一级学科硕士学位授权点以及机械硕士专业硕士学位授权点，并且设有农业工程一级学科博士后科研流动站；拥有农业机械化及其自动化等 6 个本科专业，其中农业机械化及其自动化专业先后获得省级品牌专业、省级特色专业、省级一流本科专业建设点和国家级一流本科专业建设点，农业电气化专业也获批了省级一流本科专业建设点。

学院拥有洛阳一拖集团这一校外教学实习基地；拥有太原第一热电厂这一校外教学实习基地；拥有平遥减速器有限公司这一校外教学实习基地；拥有山西吉利汽车部件有限公司这一校外教学实习基地。

特聘中国工程院院士赵春江担任省重点实验室学术委员会主任和博士生导师。国家燕麦荞麦产业体系有 1 位岗位科学家，山西省现代农业产业技术体系有 7 位专家，山西省科教兴晋突出贡献专家有 2 人。近年来，学院承担的国家级和省部级科研项目有 90 余项。学院发表的学术论文超过 300 余篇。其中，被 SCI 和 EI 收录的论文有 150 余篇。学院出版的专著、教材达 30 余部。学院获得的发明专利、实用新型专利、软件著作授权有 150 余件。学院获得的科研成果和省部级奖有 10 余项。

学院的在校博士和硕士研究生大概有 200 人，本科生有 1800 多人。学院的毕业生就业率在全校处于领先地位，并且连续多年获得学校“学生就业工作先进单位”的称号。

学院将强农兴农当作自身的责任，把立德树人这一根本任务贯彻落实。围绕着一流学院以及一流学科专业的建设目标，持续对学科方向和专业结构进行优化。充分把学科学科专业的特色优势发挥出来。持续推动教育教学在内涵以及特色方面得到发展。提升学院在教学、科研和社会服务方面的能力。接续努力推进学院朝着高质量的方向发展。